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核酸组学平台


发布日期:2021-06-01 15:51:02 作者: 来源:

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 平台名称:核酸组学平台

 所属中心:精准诊断研究中心 

中心副主任:许伟宏

平台负责人:李莹

 联系方式:15012662575

    邮箱:liying@ipm-gba.org.cn 


 (编者注:本页面内容更新于2024年9月)


【平台简介】

基因测序是生物医学科研不可或缺的工具,是精准医疗的基础,也是精准医学产业的重要组成部分。核酸组学技术平台为研究院各大课题组及外部科研单位与企业提供高通量测序上下游全套服务,包含高通量测序实验设计咨询与合理性评估、核酸样本提取及质控、测序文库制备及上机测序,并依托精准医学大数据平台提供标准化生信分析及个性化数据分析等。

 

【支撑团队】

核酸组学平台属于精准诊断研究中心,现已建立9余人的团队,其中研究员1人,青年研究员2人;技术实验人员3名,生信分析工程师1名;3人持PCR上岗证,1人持特种设备作业证;3人已取得贝克曼高通量自动化移液工作站Biomek i7培训通过证书。

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【硬件条件】

平台实验室面积约200m2,配备独立新风空调系统,涵盖试剂准备、样本制备、文库制备、扩增与质控以及测序等五大功能区,满足高通量测序湿实验全流程要求。2023年以满分100分通过国家卫生健康委员会临床检验中心的室间质评。

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【技术服务内容】

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【重要仪器设备】

1.非接触式超声破碎仪

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一次可同时处理1-16支样本;独特ACT (Adaptive Cavitation Technique),可产生高效温和的超声波, 快速均匀的剪切核酸、染色质与细胞样本, 不伤害样本的结构与活性;应用涵盖DNA, RNA, FFPE, chromatin破碎; 破细胞/组织提蛋白; 蛋白质质谱样本处理;无探头式设计, 样本在密闭容器下破碎, 无感染性飞雾, 样本不产泡不变性。

 

2.全自动核酸提取仪VNP-32P

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一款高通量、高精度运行的核酸提取设备;搭配基于超顺磁性硅基磁珠的预封装提取试剂可从血液、组织、细胞、体液、细菌和病毒等多种生物样本中提取和纯化核酸;通过磁棒的吸附、转移和释放磁珠,实现核酸的纯化和富集;操作自动化程度高、快速简便。

 

3.安捷伦自动化核酸分析仪Agilent 4200 Tapestation

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用于核酸样品质量控制的成熟、高通量自动化电泳平台,适用于二代测序 (NGS)、生物样本库或疫苗开发工作流程。

DNA质控:基因组DNA(DINe)、游离DNA、ChIP-DNA、cfDNA检测

RNA质控:完整性评估(RINe)

文库质控:文库大小分布

 

4.全自动核酸电泳回收仪Sage Science BluePippin

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回收的DNA样本可用于: 测序建库(一代、二代、三代);常规分子生物学实验(DNA克隆、重组、转染、转化、转导、杂交、互作、结构分析)。回收精确度达93-99%;50-80%的回收得率;手工操作时间短,无需额外制胶和切胶。

 

5.高通量自动化移液工作站Biomek i7 Hybrid (MC + Span-8)

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具备45个板位,一次通量96-384个样本;同时配置96通道和8通道灵活加样器,以及双夹板机械手。

 

【其他辅助设备】

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