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蛋白质与糖组学平台
发布日期:2021-06-01 15:37:46 作者: 来源:
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平台名称:蛋白质与糖组学平台
所属中心:精准诊断研究中心
中心副主任:许伟宏
平台负责人:祁龙凯
联系方式:13560228344
邮箱:qilongkai@ipm-gba.org.cn
(编者注:本页面内容更新于2024年9月)
【平台简介】
蛋白质与糖组学平台依托复旦大学人类表型组研究院、生物医学研究院和生命科学学院的深厚技术基础,建立临床组织样本蛋白质组高通量、快速检测技术体系,发展微量、痕量、低丰度蛋白样本的深度鉴定技术,探索面向临床的蛋白质组与糖组深度精准分析方法,可为研究院及大湾区高校、科研院所、企业等单位提供精准蛋白质组学、修饰蛋白质组学及糖组学标准化和差异化科研与转化服务。
蛋白质与糖组学平台目前购置有业内一流分析测试设备,包括TimsTOF Pro2捕集离子淌度飞行时间质谱仪、rapifleX MALDI-TOF/TOF基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪及NanoLC-Qtrap 6500+三重四级杆线性离子阱复合质谱仪,结合复旦大学在蛋白质组及糖组学分析领域的领先技术优势,重点发展微量、痕量、低丰度蛋白样本的深度鉴定技术与面向临床的蛋白质糖基化深度精准分析技术,可实现低丰度蛋白质和蛋白质翻译后修饰(糖基化、磷酸化等)的高覆盖、高通量、高灵敏度定性和定量分析,为相关产品研发和产业化提供坚实保障。
【支撑团队】
蛋白质与糖组学平台属于精准诊断研究中心,现已建立9余人的团队,其中研究员1人,青年研究员2人;技术人员1名。
祁龙凯,广州中医药大学博士毕业,长期致力于色谱、质谱技术开发与应用研究,目前负责研究院代谢组学平台、蛋白质与糖组学平台的运维管理、项目管理和技术开发扩展等相关工作,已负责开展多项代谢组学、药代动力学等相关检测服务。
【技术服务内容】
【重要仪器设备】
1.timsTOF Pro2捕集离子淌度飞行时间质谱仪
timsTOF Pro 2 配备了最新一代双 TIMS 分析器,离子容量可提高三倍,经过简化的离子透镜最大限度地提高了离子传输效率和灵敏度。通过捕集离子淌度(TIMS)技术的引入,使用全新的平行累积连续碎裂技术( PASEF® ),实现极高的二级扫描速度(>120Hz)和灵敏度,只需要少量样本可以实现对低丰度肽段离子多次重复选择并碎裂,极大提升低丰度肽的二级谱图质量。
2.基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪rapifleX MALDI-TOF/TOF
rapifleX是Burker公司在售最高端的MALDI TOF/TOF系统,拥有包括领先的10kHz Smartbeam 3D激光器、≤10μm成像分辨率(亚细胞级别)、高达50像素/秒的扫描速度等多项革命性核心技术。可用于蛋白质的Top-down测序、糖基化结构分析和确认、二硫键或三硫键定位/错位分析及生物组织样本质谱成像等研究。
3.三重四级杆-线性离子阱符合质谱仪(NanoLC)Qtrap 6500+
QTRAP 6500+液质联用仪具有三重四极杆扫描、线性离子阱扫描、“杆一阱(QTRAP)”复合扫描功能,集合了三重四极杆的高灵敏度、高扫描速度、高通量和线性离子阱的定性功能,配合nanoESI源,能够对目标蛋白质/肽段(以及含有修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段的精准定量。
4.超高效液相色谱仪(含TUV、ELS、FLR检测器)ACQUITY UPLC H-Class
Waters™ ACQUITY™ UPLC™ H-Class PLUS系统配置四元溶剂混合功能,流速0.001~2ml/min,最大耐受15000psi,进样体积0.1~50ul,柱温箱5℃-90℃,配置荧光检测器、可见光-紫外检测器、蒸发光散射检测器与馏分收集器,可用于多种类型(无紫外吸收、紫外吸收、荧光吸收)小分子物质的定量分析。
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