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单细胞与空间组学平台
发布日期:2022-04-09 10:00:21 作者: 来源:
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平台名称:单细胞与空间组学平台
所属中心:精准诊断研究中心
中心副主任:许伟宏
平台负责人:李莹
联系方式:15012662575
邮箱:liying@ipm-gba.org.cn
(编者注:本页面内容更新于2024年9月)
【平台简介】
单细胞组学是利用高通量、高精度的测序技术对单个细胞的转录组、基因组、表观基因组等进行研究的前沿热点学科。随着测序价格每年递减和计算机算力增加,单细胞组学最终将取代现有的大量细胞测序技术,成为精准医学实施的载体和生物医学实验室的必备技术。粤港澳大湾区精准医学研究院(广州)单细胞和空间组学平台提供高通量单细胞和空间多组学分析服务,同时提供联合开发新的单细胞和空间组学技术和分析方法的平台,可与院外大课题组、生物医药公司合作申请国家级重大项目或联合开展临床队列大型课题并提供个性化数据分析。
【支撑团队】
单细胞与空间组学平台属于精准诊断研究中心,现已建立9余人的团队,其中研究员1人,青年研究员2人;技术实验人员3名,生信分析工程师1名;3人持PCR上岗证,1人持特种设备作业证;3人已取得贝克曼高通量自动化移液工作站Biomek i7培训通过证书。
【硬件条件】
平台实验室面积约200m2,配备独立新风空调系统,涵盖试剂准备、样本制备、文库制备、扩增与质控以及测序等五大功能区,满足高通量测序湿实验全流程要求。
【技术服务内容】
【重要仪器设备】
1.美天旎8通道全自动温和组织处理器
该处理器能从肿瘤组织、脾脏、肺脏、肠、肝脏、心脏和骨骼肌、神经组织、拟胚体及其他常见组织钟获得高活性单细胞。也可获得组织匀浆,用于从新鲜或冰冻组织钟提取DNA/RNA、蛋白质抽提、细胞器提取和测定病原体负载。
2.单细胞液滴文库生成仪器10x Genomics Chromium X
细胞通量高:一次可检测16个样本,最多可捕获近百万细胞;
捕获率高:细胞捕获率最高可达65%;短时高效:十几分钟内可完成上万个细胞封装,一天内获得测序文库;双细胞发生率低:单细胞捕获的多胞率从0.8%/1000个降低到0.4%/1000个。
【其他辅助设备】
粤港澳大湾区精准医学研究院
GREATER BAY AREA INSTITUTE OF PRECISION MEDICINE
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