粤港澳大湾区精准医学研究院

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微生物组学平台

发布日期:2024-09-29 18:03:16 作者: 来源:

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 平台名称:微生物组学平台

 所属中心:微生物与免疫研究中心 

 中心主任:张永振

平台负责人:李丽莉

 联系方式:13798969699

    邮箱:lilili@ipm-gba.org.cn


 (编者注:本页面内容更新于2024年9月)


【平台简介】

微生物组学平台是研究院重点建设和发展的平台之一,以国家和本地区重大需求为导向,高效、及时地获得可用于产业转化的微生物菌株与培养条件。平台瞄准本领域科研与产业的关键突破点和限速步骤,建成从人体各部位复杂样本获得具有生物医药转化前景的单个微生物及其产物的多组学筛选与稳定培养能力的技术平台,可为各企业、科研机构提供微生物领域相关技术服务。

目前开展的核心业务包括:1)微生物单细胞全基因组提取及测序分析业务:实现在单细胞水平上对微生物的分析,不仅可提供对微生物组的洞察,而且提供了更好地描述微生物与其宿主之间的细胞间关系的潜力;2)小试、中试级发酵优化业务:不断优化菌种的培养条件,为发酵领域相关企业提供小试及中试。服务客户类型集中在以研究微生物领域的客户为主,包括微生物发酵培养、微生物分离培养、微生物单细胞全基因组和全转录组的分析相关领域。

 

【支撑团队】

平台目前核心技术团队人员5人,其中全职研究员3人,平台技术人员2人。

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【技术服务内容】

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【硬件条件】

研究院微生物组学平台规划面积超100平米,仪器设备已投600万元,包括PRECI SCS-R300拉曼单细胞分选仪、KBiosystems全自动微生物克隆挑取仪、C-365 柏群四联平行反应器、50L 百仑316L不锈钢发酵罐、Coy Laboratory 厌氧手套箱、SPT Labtech firefly 全自动液体处理系统等大型设备。

 

【重要仪器设备】

1.PRECI SCS-R300 拉曼单细胞分选仪

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集成单细胞图像智能识别、多视野扫描与图像拼接、自动聚焦、一键自动检测与分选、智能数据分析与一键报告导出、全自动细胞收集等自动化功能,用于微生物、动植物细胞的拉曼检测及分选以及微塑料等微颗粒的研究。

 

2.KBiosystems全自动微生物克隆挑取仪

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全自动微生物克隆挑取,具有克隆复制,深孔接种,重排转移功能;采用32针气动式挑取头,挑取通量为800-1000克隆/小时;独有专利挑取枪头,并提供图片识别、菌落形状大小分析、挑取高度等设置,令挑取达到极高的准确度和质量。

 

3.C-365 柏群四联平行反应器

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通过对细胞发酵过程中搅拌速度、温度、pH值、DO、消泡、液位控制、气体混合控制等进行实时监测与控制,进行数据卸载,数据分析成表及细胞发酵过程控制等高级操作,用于微生物发酵、细胞培养等工艺条件的优化。

 

4.50L 百仑316L不锈钢发酵罐

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主体材质为全不锈钢316L罐体,罐内无死角;带发酵罐专用取样、放料阀,移种管道。用于微生物发酵、细胞培养等工艺条件的中试放大培养。

 

5.Coy Laboratory 厌氧手套箱

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细胞培养、人体共微生物培养、环境细菌培养。

 

6.CI-191TX 气套式触屏三气培养箱

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191系列气套式触屏三气培养箱除提供温度控制、浓度控制外,还通过氮气来降低箱体内的氧气浓度,适合不同部位人体或动物细胞的培养使用。供临床检验用于生物细胞、组织、细菌培养用。

 

7.SPT Labtech firefly 全自动液体处理系统

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创新的一体化液体处理技术,整合移液和分液模块于一身,以实现更高效的NGS建库和样本制备工作流程。用于微生物单细胞、宏转录组等实验以及NGS文库制备、磁珠纯化、qPCR和PCR体系构建、反应体系微缩化。

 

8. 5075ELVC腾氏灭菌器

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高压蒸汽灭菌器是采用高温饱和水蒸气作为介质,利用蒸汽冷凝释放的潜热杀灭微生物对液体、玻璃器皿、器械、织物、敷料、动物笼具、废气物等物品的灭菌。

 

【其他辅助设备】

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