粤港澳大湾区精准医学研究院

GREATER BAY AREA INSTITUTE OF PRECISION MEDICINE

研究队伍

RESEARCH TEAM

精准诊断研究中心 | 谢一轩

发布日期:2024-09-30 15:14:12 作者: 来源:

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 所属部门:精准诊断研究中心   

    职称:青年研究员

 电子邮箱:xieyixuan@ipm-gba.org.cn   

    学历:博士

 研究方向:生物质谱分析,糖组学,蛋白质组学,表观组学

 

实验室网站

https://glycoxielab.org/

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个人介绍

谢一轩,复旦大学粤港澳大湾区精准医学研究院(广州)青年研究员。课题组研究方向致力于通过质谱为核心的多组学技术表征蛋白质和核酸的修饰,并揭示其在生物学过程中的关键功能。研究领域包括:1) 蛋白质糖基化的精确表征及其在蛋白相互作用组中的功能揭示;2) 新型生物分子糖RNA的结构与功能研究;3) 核酸分子化学修饰分析;4) 组蛋白修饰及其生物功能解析。在Cell, Nature, Science, Nature Protocols, Chemical Science, Analytical Chemistry等顶级期刊发表论文30余篇,其中首次揭示了生物组蛋白H4上的新型乙酰甲基赖氨酸修饰(Nature 2023),并鉴定出acp3U作为糖RNA分子中N-聚糖连接的机制,为糖RNA的存在提供了直接证据(Cell 2024)。未来课题组将进一步探究不同化学修饰在疾病发生和发展中的作用,尤其是针对糖基化在癌症等重大疾病中的潜在应用,力求推动相关领域的基础研究向临床转化。


荣誉获奖

2022年,Elliot L. Elson 教育与培训奖

2023年,美国质谱协会博士后发展奖

2024年,《Journal of Proteome Research》蛋白质组及代谢组学术新星


代表性论文著作

1. Xie, Y.; Chai, P.; Till, N. A.; Hemberger, H.; Watkins, C. P.; Lebedenko, C. G.; Caldwell1, R. M.; George, B. M.; Bertozzi, C. R.; Garcia, B. A.; Flynn, R. A., The modified RNA base acp3U is an attachment site for N-glycans in glycoRNA. Cell 2024. (本人标注:共同第一作者)

2. Xie, Y.; Chen, S.; Alvarez, M. R.; Sheng, Y.; Li, Q.; Wong, M.; Lebrilla, C. B., Deciphering fucose spatial environment using proximity labeling. Chemical Science 2024, 15(13), 4189. (本人标注:共同第一作者)

3. Xie, Y; De Luna Vitorino, F.N.; Chen, Y; Lempiäinen, J. K.; Zhao, C.; Steinbock, R. T.; Liu, X.; Lin, Z.; Zahn, E.; Garcia, A. L.; Weitzman, M. D.; Garcia, B. A., SWAMNA: a comprehensive platform for analysis of nucleic acid modifications. Chemical Communications 2023, 59(83), 12499-12502. (本人标注:唯一第一作者)

4. Lu-Culligan, W. J.; Connor, L. J.; Xie, Y.; Ekundayo, B. E.; Rose, B. T.; Machyna, M.; Bhanu, N. V.; King, M. C.; Garcia, B. A.; Bleichert, F.; Simon, M. D., Acetyl-methyllysine marks histone H4 in regulated chromatin. Nature 2023, 622, 173-179. (本人标注:其他情况)

5. Xie, Y.; Janssen, K. A.; Scacchetti, A.; Porter, E.G.; Lin, Z.; Bonasio, R.; Garcia, B. A., Permethylation of Ribonucleosides Provides Enhanced Mass Spectrometry Quantification of Post-Transcriptional RNA Modifications. Analytical Chemistry 2022, 94(20), 7246-7254. (本人标注:唯一第一作者)

6. Xie, Y.; Chen, S.; Li, Q.; Sheng, Y.; M. R. Alvarez; J. Reyes; G. Xu; K. Solakyildirim; Lebrilla, C. B., Glycan-protein cross-linking mass spectrometry reveals sialic acid-mediated protein networks on cell surfaces. Chemical Science 2021, 12(25), 8767. (本人标注:唯一第一作者)

7. Xie, Y.; Sheng, Y.; Li, Q.; Ju, S.; Reyes, J.; Lebrilla, C. B., Determination of the glycoprotein specificity of lectins on cell membranes through oxidative proteomics. Chemical Science 2020, 11(35), 9501-9512. (本人标注:唯一第一作者)

8. Li, Q.; Xie, Y.; Wong, M.; Barboza, M.; Lebrilla, C. B., Comprehensive structural glycomic characterization of the glycocalyxes of cells and tissues. Nature Protocols 2020, 15(8), 2668-2704. 1. (本人标注:其他情况)


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